Načrtna shema in rešitev polipeptidne peptidne verige

I. Povzetek
Peptidi so posebne makromolekule, tako da so njihova zaporedja nenavadna po svojih kemičnih in fizikalnih lastnostih.Nekatere peptide je težko sintetizirati, medtem ko je druge relativno enostavno sintetizirati, vendar jih je težko očistiti.Praktična težava je, da je večina peptidov rahlo topnih v vodnih raztopinah, zato je treba pri našem čiščenju ustrezen del hidrofobnega peptida raztopiti v nevodnih topilih. Zato bodo ta topila ali pufri verjetno resno neskladna z uporabo. bioloških eksperimentalnih postopkov, tako da je tehnikom strogo prepovedano uporabljati peptid za lastne namene, tako da je v nadaljevanju nekaj vidikov oblikovanja peptidov za raziskovalce.

Načrtna shema in rešitev polipeptidne peptidne verige
Drugič, pravilna izbira sintetičnih težkih peptidov
1. Skupna dolžina navzdol reguliranih zaporedij
Peptide z manj kot 15 ostanki je lažje pridobiti, ker se velikost peptida poveča in čistost surovega produkta zmanjša.Ker se skupna dolžina peptidne verige poveča nad 20 ostankov, je natančna količina izdelka ključna skrb.V mnogih poskusih je enostavno doseči nepričakovane učinke z znižanjem števila ostankov pod 20.
2. Zmanjšajte število hidrofobnih ostankov
Peptidi z veliko prevlado hidrofobnih ostankov, zlasti v regiji 7-12 ostankov od C-konca, običajno povzročajo sintetične težave.To se vidi kot neustrezna kombinacija prav zato, ker se pri sintezi dobi B-zgiban list."V takih primerih je lahko koristno pretvoriti več kot dva pozitivna in negativna ostanka ali vstaviti Gly ali Pro v peptid, da odklenete peptidno sestavo."
3. Zmanjšanje "težkih" ostankov
"Obstajajo številni ostanki Cys, Met, Arg in Try, ki jih na splošno ni mogoče enostavno sintetizirati."Ser bo običajno uporabljen kot neoksidativna alternativa Cys.
Načrtna shema in rešitev polipeptidne peptidne verige

Tretjič, izboljšajte pravilno izbiro topnega v vodi
1. Prilagodite N ali C konec
Glede na kisle peptide (to je negativno nabite pri pH 7) je za povečanje negativnega naboja posebej priporočljivo acetiliranje (N-konec acetilacije, C-konec vedno ohranja prosto karboksilno skupino).Vendar je za bazične peptide (to je pozitivno nabite pri pH 7) še posebej priporočljiva aminacija (prosta amino skupina na N-koncu in aminacija na C-koncu) za povečanje pozitivnega naboja.

2. Močno skrajšajte ali podaljšajte zaporedje

Nekatera zaporedja vsebujejo veliko število hidrofobnih aminokislin, kot so Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr in Ala itd. Ko ti hidrofobni ostanki presežejo 50 %, jih običajno ni enostavno raztopiti.Morda bi bilo koristno podaljšati zaporedje za nadaljnje povečanje pozitivnih in negativnih polov peptida.Druga možnost je znižanje velikosti peptidne verige za povečanje pozitivnih in negativnih polov z znižanjem hidrofobnih ostankov.Močnejše kot so pozitivne in negativne strani peptidne verige, večja je verjetnost, da bo reagirala z vodo.
3. Vstavite vodotopen ostanek
Pri nekaterih peptidnih verigah lahko kombinacija nekaterih pozitivnih in negativnih aminokislin izboljša topnost v vodi.Naše podjetje priporoča, da se N-konec ali C-konec kislih peptidov kombinira z Glu-Glu.Podan je bil N ali C konec bazičnega peptida in nato Lys-Lys.Če naelektrene skupine ni mogoče postaviti, se lahko Ser-Gly-Ser postavi tudi na N ali C terminal.Vendar ta pristop ne deluje, če strani peptidne verige ni mogoče spremeniti.