Ti protimikrobni peptidi so bili prvotno pridobljeni iz obrambnih sistemov žuželk, sesalcev, dvoživk itd. in vključujejo predvsem štiri kategorije:
1. cekropin je bil prvotno prisoten v imunski limfi Cecropiamoth, ki se nahaja predvsem v drugih žuželkah, podobne baktericidne peptide pa najdemo tudi v črevesju prašičev.Zanje je tipično značilna močno alkalna N-terminalna regija, ki ji sledi dolg hidrofobni fragment.
2. Protimikrobni peptidi Xenopus (magainin) so pridobljeni iz mišic in želodca žab.Ugotovljeno je bilo tudi, da je struktura protimikrobnih peptidov xenopus spiralna, zlasti v hidrofobnih okoljih.Konfiguracijo ksenopusovih antipeptidov v lipidnih plasteh smo proučevali z N-označeno trdno fazno NMR.Na podlagi kemijskega premika acilaminske resonance so bile vijačnice antipeptidov ksenopusa vzporedne dvoslojne površine in so se lahko zbližale v 13 mm kletko s periodično spiralno strukturo 30 mm.
3. defensin Obrambni peptidi izvirajo iz človeških polikariontskih nevtrofilcev zajčjih polimakrofagov s popolnim jedrnim lobulom in črevesnimi celicami živali.Skupina protimikrobnih peptidov, podobnih obrambnim peptidom sesalcev, je bila ekstrahirana iz žuželk, imenovanih "obrambni peptidi insektov".Za razliko od obrambnih peptidov pri sesalcih so obrambni peptidi žuželk aktivni samo proti gram-pozitivnim bakterijam.Celo peptidi za zaščito pred žuželkami vsebujejo šest ostankov Cys, vendar je metoda medsebojnega disulfidnega povezovanja drugačna.Način vezave intramolekularnega disulfidnega mostu protibakterijskih peptidov, ekstrahiranih iz Drosophila melanogasta, je bil podoben načinu obrambnih peptidov rastlin.V kristalnih pogojih so obrambni peptidi predstavljeni kot dimeri.
4.Tahiplesin izhaja iz podkovnjakov, imenovanih podkovnjaki.Študije konfiguracije kažejo, da ima antiparalelno B-zgibno konfiguracijo (3-8 položajev, 11-16 položajev), v kateriβ-kota sta med seboj povezana (8-11 položajev), med položajem 7 in 12 ter med položajem 3 in 16 nastaneta dve disulfidni vezi.V tej strukturi se hidrofobna aminokislina nahaja na eni strani ravnine, šest kationskih ostankov pa se pojavi na repu molekule, zato je struktura tudi biofilna.
Iz tega sledi, da so skoraj vsi protimikrobni peptidi kationske narave, čeprav se razlikujejo po dolžini in višini;Na visokem koncu, bodisi v obliki alfa-vijačnice ozβ- skupna značilnost je zložljiva bitropna struktura.
Čas objave: 20. aprila 2023